大鼠失神经早期快慢肌miRNA表达谱比较及其靶基因预测

来源 :全国手部功能重建研讨会、中华医学会手外科学分会华北地区第十届手外科学术会议暨内蒙古自治区第三届手外科学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yijianlou
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  目的:通过检测失神经早期快慢肌microRNA(miR)的表达谱及预测其靶基因和信号传导通路(Pathway),从表观遗传学角度阐述失神经早期miR在快慢肌萎缩中不同的调控机制.方法:实验选取SD雌性大鼠20只随机分配至4组,切断坐骨神经制造失神经模型,选取失神经后0,7,14和28天的慢肌(比目鱼肌,soleus muscle,SM)和快肌(胫骨前肌,tibialis anterior muscle,TAM)样本.使用miR芯片检测骨骼肌miR表达谱,从表达谱中选取23个miRs利用RT-PCR进行验证.使用随机方差模型修正的F检验计算差异的显著性水平(P-value)和误判率(FDR)得到差异miR,进行miR表达趋势显著性分析获得显著性的miR表达趋势及对应的miR.分别通过TargetScan、miRanda两种方法进行差异miR靶基因预测,最后采用两种方法都能够预测到的靶基因作为后续分析的目的靶基因.利用Pathway分析筛选得到关键的Pathway,制作显著性Pathway间相互作用网络,得到核心调控pathway及关键miR.结果:1.和SM相比,TAM在0,7,14和28天时有51,54,57和57个miRs表达量不同(Multi-class Dif-multiple comparison test RVM-F test,P<0.05,FDR <0.05,afold change>2).2.在检测的389 miRs中SM有9.8% (38) miRs明显变化,4 miRs(miR-17-1-3p,miR-152,miR-22 and miR29a)上调,34miRs下调;TAM有23.9%(93)miRs明显变化,29 miRs上调,64miRs下调.3.SM和TAM 差异miR有24个相同,但SM差异miRs中有14个在TAM中未出现表达量的变化.4.RT-PCR验证结果与芯片检测结果一致,差异没有统计学意义(P>0.05).5.SM和TAM中差异miR的显著性表达趋势均为3个.6.SM靶基因参与的pathway 124条,其中显著性pathway46条,关键pathway36条.TAM趋势上调的miR靶基因参与的pathway122条,显著性pathway44条,趋势下调的miR靶基因参与的pathway 127条,显著性pathway51条.TAM中关键pathway59条.结论:miR在失神经肌萎缩过程中的表达有时序性,在不同时间段主要以表达不同种类miR和同一种miR不同表达量的方式从基因转录后水平精细的调控整个过程.失神经慢肌萎缩和失重力肌萎缩有类似机制,miR-206,miR-195,miR-23a和miR-30e可能通过靶基因Bdnf,Mylk,Ve出,Ywhag,Ntrk2和Ywha2参与了将慢肌纤维转化为快肌纤维.失神经快肌萎缩可能是一种代偿机制,miR-152,miR-320,Let-7e和miR-214可能通过靶基因Adaml0,Robo2,Grb2,Smad3和Co15a2发挥调节作用.
其他文献
笔者多年从事沪教版教材的教学,教学多年结合最近几年上海中考以及各种中考模拟试题,很多题目都源于教材,而又高于教材,教师在日常教学过程中如果能对教材中的例题深度研究和
初中英语教学不仅要让学生掌握英语基础知识,还要适当地培养学生的中外文化意识。在初中英语教学中既要宣传本国的传统文化,还要促进学生对国外文化的了解,使得学生能得体地
  肌腱损伤已成为临床常见病,在儿童至老年人都较为多见。但是,现在还有许多难题亟待解决,肌腱修复后粘连及再断裂问题一直萦绕着临床工作者。同时学者们对肌腱愈合各种影响因
合作学习在现代教育中的作用越来越明显.幼儿教育作为学校教育的初始阶段,对于合作意识的养成至关重要,所以探究如何在幼儿园进行科学教学的小组合作学习具有十分重要的现实
期刊
  目的 探讨用桡侧腕屈肌腱片移植的方法治疗指伸肌腱终腱闭合断裂型锤状指(腱性锤状指)的手术效果.方法 采用关节固定、指伸肌腱修补加腱片移植的方法修复17例新鲜腱性锤
1 写作内容的创新rn有一些小学生在写作文的时候,常常会觉得自己没有写作材料,他们或者会无病呻吟,或者会写作的内容空洞.为学生准备好充分的材料,使学生有内容可写,是教师在
期刊
  目的:通过观察不同时期异种肌腱修复肌腱缺损的微观变化,为异种肌腱作为临床组织工程化肌腱生长支架提供实验依据.方法:切取月龄(6个月)相同Leghorn鸡屈趾肌腱经化学去细胞
会议
数学作为小学教育中的重要学科,其中包含了数字图形等多方面的知识,对学生思考能力,思辨能力等的要求很高,所以小学数学教师就必须要重视对学生独立思考能力的培养,强调采用
期刊
本文通过对部分中考压轴题的研究,提出利用坐标解析的方法来解决几何探究题,降低题目的思维量,从而达到事半功倍的效果.