【摘 要】
：
细胞色素P450 酶系(CYP)是由许多同工酶组成的超大家族,是一类能催化胆固醇、类固醇及其他脂质合成和药物代谢等多种反应的单加氧酶,在调节机体与外界环境的相互作用以及
【机 构】
：
吉林大学理论化学研究所,理论化学计算国家重点实验室,长春 130023
论文部分内容阅读
细胞色素P450 酶系(CYP)是由许多同工酶组成的超大家族,是一类能催化胆固醇、类固醇及其他脂质合成和药物代谢等多种反应的单加氧酶,在调节机体与外界环境的相互作用以及保持机体内环境稳定中起重要作用[1,2].CYP17A1(全称为细胞色素P450c17α)是细胞色素P450 酶系家族成员之一,该酶同时具有17α-羟化酶、17,20-裂解酶的活性,是一类典型的膜结合的双功能单氧酶,在类固醇性激素合成的途径中起关键作用,是治疗前列腺癌和乳腺癌的重要靶标[3,4].它可有效地抑制性激素的合成,从而控制癌细胞的转移.但由于缺乏其三维结构信息,相关药物的研究受到严重制约.2012 年,美国KANSAS 大学的E.E.Scott教授课题组首次报道了CYP17A1 的晶体结构信息[5].此外,膜磷脂在各种氧化还原配体间的促进和调节,以及作为底物的载体进入P450 酶并接近通道和活性部位等多方面起到重要作用.因此,为了模拟P450 酶系在人体中的真实环境,在计算时引入膜是非常必要的.目前为止,关于该酶系在膜磷脂存在情况下的结构与功能的理论研究工作鲜见报道.本文在膜磷脂存在的情况下,从原子水平对CYP17A1 的结构和功能进行深入系统地研究.通过全原子动力学模拟,探索CYP17A1 从膜表面插入膜的动态过程,并结合实验数据获得CYP17A1 蛋白与膜结合的角度、深度等结构特征,体现了CYP17A1 与膜结合过程存在特异相互作用,而非仅仅依靠简单的吸附作用.此外,本文发现膜与CYP17A1 结合后一定程度上影响了面向膜的底物进出蛋白通道的开合状况,这种情况在其他的P450 酶中也有体现[6,7].综上所述,本文阐述了CYP17A1 酶在人体中的真实环境中的结构特征及膜磷脂对于CYP17A1 酶结构的影响,为今后关于P450 酶系生物膜模拟提供了成熟可行的研究方案和技术手段.
其他文献
All-atom molecular dynamics simulations for the liquid droplets of water,benzene,methanol,ethanol,propanol,butanol,phenylmethanol,2-phenyl-ethanol,3-phenyl-
荧光光谱学方法是一种高灵敏的检测物质中微量荧光物质的有效手段。但是在实际情况中,人们常常会遇到如下问题:在样品溶液中不仅存在样品溶质A,亦存在少量干扰性物质B。在相应的荧光发射光谱上,A的荧光特征峰与B的荧光特征峰高度重叠。由于A的含量远大于B,使得B的荧光特征峰完全被A所覆盖,因此在一维光谱上差异不显著,这使得在A的强大背景下如何检测出B是一个巨大的挑战。鉴于日本科学家Noda提出的二维相关光谱
We develop a new method for exploring multidimensional free energy surfaces(FESs)of ligand-protein interaction systems named Adaptive Metadynamic Binding.In
镉(Cadmium,Cd)作为有毒重金属严重影响植物的生长。当粮食作物中的Cd含量超标时便会通过食物链给人类健康造成极大威胁。水稻是全世界,尤其是东南亚地区的主要粮食作物之一。然而,环境污染造成土壤中的镉大量积累。由于镉具有较好的迁移性,在被水稻根系吸收后能够以较快的速度移动至地上部,最后沉积在籽粒中。因此,如何减少水稻Cd污染一直是农业科技领域亟待解决的问题。水稻根系分泌物,如有机酸,一直被认为
一、前言rn支架式教学模式是基于建构主义理论的核心教学模式之一,源于前苏联心理学家Vygotsky的最近发展区理论.支架式教学是指应当为学习者构建对知识的理解提供一种概念框
铁元素是生命体中必不可少的微量元素，在生物的生长发育过程中发挥着重要作用。铁蛋白，一种分布广泛的球形蛋白，能够以稳定的形式大量储存铁。铁蛋白通过储存和释放铁来维持机体
二氧化铪(HfO2)由于热力学稳定性好、介电常数高和具有宽带隙,被认为是未来最有希望替代金属-氧化物-半导体场效应晶体管的栅极绝缘层SiO2 的材料.含―Cp 环的金属有机化
燃料的燃烧是主要的污染源之一，此过程会释放对人类有害的有毒物质硫氧化物。在油和液体燃料中具有大量芳香硫化物，如二苯并噻吩(DBT)、苯并噻吩(BT)和噻吩(T)。为了控制硫的排