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以21个茶树品种为材料,根据茶树查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS) CHS2基因cDNA序列(D26594)两端非编码区设计引物,进行PCR扩增,获得CHS2外显子Ⅰ和外显子Ⅱ全部序列.研究结果发现：(1)外显子Ⅰ有15个SNPs,2个InDels,单倍型多样性指数(Hd)为0.813,核苷酸多样性指数(Pi)为0.01207；(2)外显子Ⅱ有37个SNPs,28个InDels,单倍型多样性指数为0.962,核苷酸多样性指数为0.0505；(3)聚类分析结果表明,茶树CHS2基因外显子Ⅱ能较好反映不同茶树品种适制性.