【摘 要】
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通过对实验室已构建的柱花草炭疽菌T-DNA突变体库中各突变体致病力的测定,获得致病力丧失突变菌株994.对其进行菌落生长速率、菌落形态及产孢量等生物学特性的研究,利用TAIL-PCR克隆标记基因侧翼序列,分析T-DNA插入位点,通过本地blast比对进行序列分析,采用生物信息学方法进行基因预测及功能分析.结果表明,与柱花草炭疽菌野生型菌株CH008相比,突变菌株994表现致病力丧失,生长速率(1.
【机 构】
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中国热带农业科学院环境与植物保护研究所,海口 571101;海南大学农学院,海口 570228 海
【出 处】
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中国植物保护学会2015年学术年会
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通过对实验室已构建的柱花草炭疽菌T-DNA突变体库中各突变体致病力的测定,获得致病力丧失突变菌株994.对其进行菌落生长速率、菌落形态及产孢量等生物学特性的研究,利用TAIL-PCR克隆标记基因侧翼序列,分析T-DNA插入位点,通过本地blast比对进行序列分析,采用生物信息学方法进行基因预测及功能分析.结果表明,与柱花草炭疽菌野生型菌株CH008相比,突变菌株994表现致病力丧失,生长速率(1.32±0.02)cm/d,与野生型(1.41±0.03)cm/d无显著性差异;产孢量(3.04 ±0.15)×106个/mL,显著低于野生型(9.26 ±0.14)×106个/mL;孢子萌发率(0.00±0.00)%,显著低于野生型(91.14±6.66)%;在分生孢子形态、附着胞形成等方面与野生型并无明显差异.TAIL-PCR扩增得到T-DNA插入位点RB端侧翼序列680 bp,LB端侧翼序列495 bp,经两侧序列拼接本地blast比对,与全基因组同源性为79%,进行生物信息学分析,预测T-DNA插入位点为基因末端外显子附件区域,ORF开放阅读框分析基因编码556个氨基酸,NCBI检索所得基因属焦磷酸硫胺素(TPP)家族,乙酰乳酸合成酶(AHAS)亚科,与乙酰乳酸合成酶催化亚基相似的蛋白质组成.
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吉陶单极虫(Thelohanellus kitauei)是我国及东北亚地区淡水鲤科鱼类粘孢子虫病的主要病原之一,可引起池塘、水库、湖泊养殖鲤科鱼类大批死亡.缺乏遗传信息是制约控制吉陶单极虫病药物发展的关键.本研究完成了吉陶单极虫基因组及其孢子阶段转录组的测序工作, 采用Roche 454和Illumina两种测序平台对吉陶单极虫基因组进行测序,用拼接好的5610个支架组装成一个150.7 Mb的吉
Axillary bud outgrowth is greatly influenced by auxin, cytokinin (CK) and strigolactone (SL).Although the respective inhibitory and stimulatory effects of auxin and CK have been studied for many years
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