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仲景不仅将理论与临床有机的结合，而且更重要的是确立理法方药的辨证论治原则，特别是对于确立了外感疾病的总治疗原则—六经辨证论治。六经辨证是仲景为外感热病确立的行之有效的辨证方法，故六经辨证被后世誉为辨证论治之祖。六经病辨证，实质上是对外感疾病不同阶段的综合性认识。它包括了人体正气的强弱、外感邪气的轻重、机体的反应程度、病情的转归趋势以及体现在外表的各种症状的综合反应。对于每一个具体的病证，都根据发病的不同脏腑、不同部位、不同阶段而分清其阴、阳、表、里、寒、热、虚、实的不同性质，来决定治疗原则。