鸭疫里默氏杆菌Ⅰ型磷酸二酯酶基因的发现及其分子特征分析

• 作 者: 陈虹[1]程安春[2]汪铭书[3]朱德康[1]
• 机 构: 四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心,四川雅安,625014
• 出 处: 中国畜牧兽医学会动物微生态学分会第四届第九次全国学术研讨会暨饲料和动物源食品安全战略论坛
• 发表日期: 2008年期

以兔抗鸭疫里默氏杆菌(RA)阳性血清对RA血清1型CH-1株表达型DNA文库中已通过蓝白斑筛选的一个阳性克隆进行原位杂交筛选。经过5次免疫筛选后,阳性斑经过体内删除、噬菌粒经酶切分析和序列测定,得到一段4434bp的插入DNA片段。运用NCBI的BLASTN、BLASTP、ORF Finder、Conserved Domains、EMBL的FASTA等程序对其中一个命名为ORF1689的开放阅读框架进行了全面的生物信息学分析。结果显示ORF1689起始密码子上游存在核糖体结合位点,完整ORF含1689bp,编码562 aa,其编码蛋白的理论分子量为59.5kD,等电点为5.82。ORF1689具有phosphodiest蛋白家族的保守区域,与丙杆菌属的Caulobacter sp.K31、鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas sp.)、Sphingopyxis alaskensis和Novosphingobium aromaticivorans的Ⅰ型磷酸二酯酶基因的氨基酸序列同源性分别为49.283％、38.716％,38.693％和38.313％,表明该基因是一种新的Ⅰ型磷酸二酯酶基因。该研究结果对阐明Ⅰ型磷酸二酯酶的生物学功能和RA的生理特性与致病机理提供了理论基础和实验数据。