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目的：了解2009年内蒙古盟市、旗县(区)两级健康教育机构与人力资源现状。方法：采用《2009年健康教育所(中心)业务工作调查表及基本情况调查表》(卫统46表)对内蒙古盟市、旗县(区)两级健康教育机构设置、人力资源、经费和活动形式进行问卷调查。结果：全区12个盟市中有7个盟市级健康教育所为独立建制；104个旗县(区)中基本均有健康教育机构，其中有20个为独立建制。盟市、旗县(区)两级分别有专职健康教育人员72人和191人，两级机构人员学历以本科和大专为主，职称构成均以中级和初级为主，医学背景(公共卫生或临床医学)人员比例仅为人员总数的23.97％，两级健康教育机构的经费主要来源于财政拨款，健康教育机构的工作形式仍停留在印刷小册子、折页、宣传画、举办健康知识讲座等一般化的卫生宣传上。结论：内蒙古自治区健康教育机构存在管理体制不顺、专业人员数量偏少及整体素质偏低、财政投入不足、活动形式过于老化与单一等突出问题，需要在医药卫生体制改革中得到解决。