牛HGF基因的CDS区全长克隆与起源进化分析

来源 :中国畜牧兽医学会养牛学分会第八届全国会员代表大会暨2015年学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dwddKTV
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本研究克隆了牛HGF基因的蛋白质编码区全长,并对其CDS(Coding Region Sequence)区序列和编码蛋白的氨基酸序列进行生物信息学分析,为后续在牛上开展HGF基因的功能研究奠定基础。本试验获得了牛HGF基因的CDS区,并成功构建T-HGF质粒。利用生物信息学手段分析发现,预测的牛HGF蛋白结构域与已有报道的其它物种HGF蛋白结构一致,说明HGF蛋白高度保守,在其它物种上研究的HGF的功能可以推广到牛上进行研究。HGF蛋白氨基酸序列与其它9个物种的HGF蛋白氨基酸序列进行比对,并构建系统发育树可知,牛HGF与其它物种都有高度的同源性,说明HGF在进化过程中高度保守。可能与HGF是一类重要的生长因子,发挥重要的生理功能有关。黄牛HGF与牦牛的进化距离和亲缘关系最近,其次是与山羊的进化距离和亲缘关系较近,而与褐家鼠的亲缘关系最远。这也从另一层次上说明牛HGF基因的功能与其它物种HGF功能的相似程度。本研究克隆获得了牛HGF基因的CDS区全长,并分析了HGF核酸序列和蛋白序列的特征,为后续HGF基因功能的研究打下实验基础。
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