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儿科样本库相对于成人具有明显的不同特点，儿科样本库建设涉及特殊的儿童伦理，知情同意书由法定监护人来签订，未成年人到18岁以后，面临捐赠意愿的变更风险。并且中国执行多年的独生子女政策，多数家庭都是以孩子为中心，给样本的捐赠带来了更多的挑战，儿童样本量较小，样本采集难度相对成人更大。儿科样本中遗传性疾病样本较多，尤其是罕见病样本的采集，对于儿科样本库来说具有特殊的意义。因而需要进一步探讨样本收集的共享机制，如何进行协作收集罕见病的临床样本，促进罕见病样本的收集，促进罕见病的研究。儿科学组提出了基于罕见病收集的儿科学组协作收集机制，牵头单位制定样本收集的标准操作规范，学组成员单位签订协作协议，愿意参与的医院，将来拥有同等的牵头进行样本收集的权利，其他签订协议的儿童医院应该相互配合和合作，促进样本库之间的协同收集。同时由学组牵头制定合作协议书，充分考虑参与样本收集单位的权利和义务，并且保障样本收集的规范化操作，符合伦理和法律规范。这只是儿科样本库建设之前的初步尝试，写作收集样本的机制还有待进一步完善。