【摘 要】
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根据GenBank上发布的新城疫病毒基因组序列，设计了9对引物，对从福建福州地区发病半番鸭场分离的新城疫病毒FJ-SMD-03株进行了基因组测序测定和分析。结果表明：FJ-SMD-03的基因纰
【机 构】
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华南农业人学兽医学院，广东广州 510640 广东省农业科学院兽医研究所，广东省兽医公共卫生公共实验室，广东广州 510640
【出 处】
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中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第一次全国鸭病防控高级研讨会
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根据GenBank上发布的新城疫病毒基因组序列，设计了9对引物，对从福建福州地区发病半番鸭场分离的新城疫病毒FJ-SMD-03株进行了基因组测序测定和分析。结果表明：FJ-SMD-03的基因纰序列由15192nt组成，在NP基因非编码区比Lasota株多了6个核苷酸ACACTC;基因组由6个ORF组成，即3-NP-P-M-F-HN-L-5序列。BLAST结果显示：FJ-SMD-03基因组核苷酸与1．3、carrier-pigeon／Guangdong／2008、pigeon／Italy／1166／00、AV324／96和dove／Italy／2736／00相似性最高，达94．9％～98．5％;与疫苗株Lasota、Mukteswar和B1的相似性最低，为80．7％～83．3％;与我国标准强毒株F48E8及2002年从福建番鸭中分离到的基因VIId型强毒株Muscovyduck／China(Fujian)／FP1／02相似性较低，分别为82．5％和 87．1％。F蛋白裂解位点的氨基酸顺序为112R-R-Q-K-R-F117，具有强毒株序列特证，进化树分析发现，FJ-SMD-03属于Class II类基因VIb亚型，证明鸭群中有VIb亚型NDV强毒株;FJ-SMD-03株NDV与1．3、carrier-pigeon／Guangdong／2008和pigeon／Italy／1166／00亲缘关系较近，与carrier-pigeon／Guangdong／2008形成一个小的进化分支，推测FJ-SMD-03株与carrier-pigeon／Guangdong／2008和pigeon／Italy／1166／00株来源于共同的祖代毒株，可能与鸽携带的病毒有关。
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