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本文对八种在全球范围内使用较多的奶牛选种选配软件分为三类进行了介绍与对比,公牛选择类软件育种红皮书功能完善,资料详尽;公牛选择器操作简捷,使用方便。遗传参数估计类的Wombat可以对方差组分估计的结果进行假设性检验的程序;MTD:FREML安装简单,各方面都相对平均;PEST是商业性质的软件,具有最好的操作界面,支持不同操作系统与平台;DMU可以处理大型数据集。而JAA/MTC的操作最为简单。综合应用类的奶牛育种模拟系统是一项非常实用的了解家畜育种工作理论基础的工具。