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以烤烟作为样本，建立了基于甲醇/水的简单有效的提取方法，以LC-MS分析平台对三个不同地域下的样本进行了分析。通过PCA以及PLS-DA分析，三组可以得到明显的分离，说明烤烟在这三种不同的地域下的代谢是有差异的。通过非参数检验分析，找到43个代谢物和三种不同的地域条件相关，包括脂肪酸(如硬脂酸、棕榈酸)、多酚(如莨菪亭)、脂类等。将找到的差异化合物和三种地域条件下的温度、降水、日照做相关性分析，发现差异化合物中的脂肪酸类和甘油脂类化合物与温度、降水成正相关，与日照成负相关;氨基酸类与温度、降水成负相关，与日照成正相关;多酚类化合物与气候的关系比较复杂。