节节麦苗期抗旱性全基因组关联分析

来源 :第六届全国小麦基因组学及分子育种大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yuantengfei1990
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  小麦是世界上最重要的粮食作物之一,受干旱的影响十分严重,节节麦是六倍体小麦D组染色体的供体种,拥有大量现有普通小麦所不具有的优良基因,所以研究节节麦的抗旱性对降低小麦干旱的损失,保障粮食安全和可持续发展等都具有重要意义.本研究对331份节节麦自然群体在正常条件下和模拟干旱条件下进行水培试验,并利用覆盖节节麦全基因组的7185个SNP进行13个抗旱相关性状的全基因组关联分析.在显著水平3.84下,一般线下模型检测到208个显著关联的SNP标记,混合线性模型下检测到28个显著相关联的SNP标记.两种模型检测一致的SNP标记数为25个,与10个抗旱性状相关,这些一致的显著性标记分布在节节麦的全部7条染色体上.使用两种模型下检测一致的25个显著性标记进行抗旱相关候选基因的预测,利用公共数据库进行比对,一共预测了15个抗旱相关的候选基因,这些基因按照功能可大致分为4类:第1类基因编码许多生化途径的酶,包括:rbcS、RUBISCO、CKX2.5、Acc-1、Acc-2、ytochrome P450和starch synthase Ⅰ;第2类基因编码储藏蛋白,包括:Glo-2、WM1.12、和WM1.7;第3类基因是春化基因VRN-B1和VRN2;第4类基因控制代谢途径的其它蛋白的合成,包括:Hotr1、Rht-A和Rht-B.本试验成功鉴定的与节节麦抗旱性状相关的SNP位点和候选基因将为今后解析节节麦及小麦抗旱的分子机制,克隆重要的抗旱候选基因,乃至培育抗旱的小麦新品种奠定一定的理论基础.
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