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目前，环糊精已被应用于有机污染物的生物有效性评估、土壤污染修复、水体污染控制等方面。环糊精一般吸附性能比较低，不易被吸附固定于土壤或沉积物等中，它们通过包合作用，可降低有机污染物的吸附性能，加快污染物的脱附，来改善污染物的生物有效性，加快环境去除。众多研究也证实，污染物与环糊精包合后，其水解、光解等速率可能增加，化学降解性能得以提高，可以减缓其环境残留。
同时，环糊精经功能材料化，可作为环境吸附剂，利用其分子识别效应，来选择性去除复杂环境基质中的污染物。此外，环糊精或环糊精功能材料可与其他氧化技术耦合，有效去除甚至完全降解残留的污染物。