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根据牛、羊和猪的线粒体DNA序列,通过PCR扩增并测序获得牦牛的线粒体DNA序列.比较牦牛与其他不同物种之间线粒体ND1和ND2序列,结果发现,ND1基因序列牦牛与其他物种同源性为67.89﹪~93.83﹪;ND2基因序列牦牛与其他物种同源性为58.46﹪~92.53﹪.牦牛与普通牛和瘤牛间的遗传距离分别为0.0758和0.0712,与鸡的遗传距离较远.采用双参数法构建了基于ND1和ND2序列的13个物种系统发育树,基本反映了物种的系统发生关系.