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戊型肝炎病毒是发展中国家急型肠道传染疾病的主要起因，主要发生在欠发达地区。零星的戊肝发生案例也在发达国家被报道，可能是传染区域输入病源或是本地病源。戊肝的研究和疫苗的研制涉及到戊肝病毒的分型。目前，戊肝病毒的分型已成为一个备受关注的研究课题。传统的戊肝病毒分型方法是基于多序列比对，而多序列比对计算复杂度高，耗时长，当比对的序列数目较多时，程序可能无法运行。本文从信息论角度提出了一种新的算法用于戊肝病毒分型，分析结果表明该方法相比于传统的多序列比对更为有效，性能更为优异。