【摘 要】
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microRNA是小的非编码RNA,是许多生理过程的重要调控者.近年来许多研究表明microRNA在动物免疫、疾病发生和衰老中具有重要调解作用.大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)属于国家一级保护动物,尽管大熊猫基因组早已测序并组装完成,但基因功能研究依然比较缺乏,有关大熊猫microRNA的研究还未见报道.本研究基于第二代测序技术,我们对四只健康大熊猫(2只老年个体和2只年轻个
【机 构】
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四川大学生命科学学院,生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064 四川省濒危野生动物保护
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microRNA是小的非编码RNA,是许多生理过程的重要调控者.近年来许多研究表明microRNA在动物免疫、疾病发生和衰老中具有重要调解作用.大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)属于国家一级保护动物,尽管大熊猫基因组早已测序并组装完成,但基因功能研究依然比较缺乏,有关大熊猫microRNA的研究还未见报道.本研究基于第二代测序技术,我们对四只健康大熊猫(2只老年个体和2只年轻个体)血液microRNA进行了测序.在两只年轻的大熊猫和两只年老大熊猫血液里,我们分别得到了20,663,662条和18,661,691条reads.经过过滤、筛选和比对,我们得到了107个已知的microRNA,55个新的microRNA.55个新的microRNA中可能有大熊猫特有的microRNA.在所有这些microRNA中,有65条microRNA的表达量具有显著差异,其中51条在年轻的大熊猫中高表达,14条在年老大熊猫中高表达.我们又对这些有表达量差异的microRNA进行了KEGG通路分析,发现他们主要与Ras signaling pathway, the PI3K-Akt signaling pathway,和the MAPK signaling pathway有关,而这些通路又都与免疫相关.本研究为进一步研究大熊猫免疫功能的调解提供了基础数据.
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