中国牛病毒性腹泻病毒JZ05-2分离株全基因测序及分析

来源 :首届中国鹿业发展大会暨中国畜牧业协会鹿业分会成立大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:heying423
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牛病毒性腹泻病毒为瘟病毒属成员,呈世界性分布且造成乳/肉牛业严重经济损失.本研究利用MDBK细胞增殖一株分离于我国吉林地区的牛源牛病毒性腹泻病毒JZ05-2毒株,观察发现具有典型的致细胞病变效应.用反转录-聚合酶链式反应(RT=PCR)分别扩增覆盖基因组全长的八个片段并测序,拼接获得该病毒的全基因序列长12 285核苷酸(nt),GenBank登陆号:GQ888686.该病毒基因组具有一个11691 nt开放读码编码多聚蛋白,5-UTR长387 nt、3-UTR长207 nt.对BVDV-2JZ05-2的5-UTR和全基因序列进行分析,发现该病毒为BVDV-2a1亚型.BVDV-2型多数毒株之间相似性约为96%,与JZ05-2全基因组序列相似性最高的美国p11Q毒株和中国XJ-04毒株分别为90%和91%.因此,JZ05-2全基因组序列与BVDV-2型其他毒株序列具有较大差异.
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