【摘 要】
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本研究参考miRBase数据库中Bantam序列,设计特异性引物,RT-PCR方法获得Bantam序列并进行生物信息学分析.利用qRT-PCR分析长角血蜱不同变态发育过程中Bantam的表达谱特征.预测
【机 构】
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中国农业科学院兰州兽医研究所 家畜疫原病原生物学国家重点实验室 甘肃省动物寄生虫病重点实验室农业部 草食动物疫病重点开放实验室,甘肃兰州730046
【出 处】
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中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第七次代表大会暨第十二次学术研讨会
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本研究参考miRBase数据库中Bantam序列,设计特异性引物,RT-PCR方法获得Bantam序列并进行生物信息学分析.利用qRT-PCR分析长角血蜱不同变态发育过程中Bantam的表达谱特征.预测其靶标基因,Cytoscape_v2.8软件模拟B antam与潜在靶标基因在代谢通路中的相互作用.Bantam序列高度保守,长角血蜱与果蝇有较近的亲缘关系.其表达丰度在卵中最高,幼蜱阶段次之,而在成蜱阶段最低.比较而言,卵中的表达丰度和蜱发育的其他阶段表达丰度差异显著(P＜0.05),幼蜱,若蜱以及成蜱之间仅有较小差异.代谢通路结果显示,Bantam可对多个靶基因进行转录后调控.同时一个靶基因也可能受到多个miRNA分子的调控.不同物种来源的Bantam序列高度保守,并在蜱不同变态发育时期具有一定的时序性.参与多个基因的表达调控过程,亦协同其他miRNA分子对靶基因功能的发挥起着重要的作用.
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