【摘 要】
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运用高通量的数字化基因表达谱测序技术,分析了草菇纽扣期(Nb)、蛋形期(Db)、伸长期(Sb)和成熟期(Cb)菌柄的基因表达谱.Nb、Db、Sb、Cb四个发育阶段菌柄基因表达标签(Cle
【机 构】
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福建农林大学菌物研究中心,福建 福州 350002
【出 处】
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中国菌物学会第五届会员代表大会暨2011年学术年会
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运用高通量的数字化基因表达谱测序技术,分析了草菇纽扣期(Nb)、蛋形期(Db)、伸长期(Sb)和成熟期(Cb)菌柄的基因表达谱.Nb、Db、Sb、Cb四个发育阶段菌柄基因表达标签(Clean tag)总数分别是5612361、5978522、5972497、5967968,标签种类分别为90437、97022、87911、83702.获得的标签与草菇基因组序列进行比对,Nb、Db、Sb、Cb发育阶段菌柄基因表达标签中比对到参考基因的转录本数目分别为10610、15329、13815、14335,部分标签定位在草菇基因组的反义链上,其比例分别为34.40％、35.83％、31.83％、31.85％.在Nb、Db、Sb、Cb四个标签库中检测到与生长发育相关的蛋白,主要是几丁质合成酶、丝裂原蛋白激酶、内切葡聚糖酶、肌动蛋白、微管蛋白、驱动蛋白等,在草菇不同的发育时期表达量不同,但变化趋势相似,这些蛋白在Db时期对应的转录本含量都比较高,推测Db时期成长旺盛,需要的能源物质较多.细胞壁合成相关的转录本含量也处于很高的水平,微管蛋白在Db时期和Sb时期转录本含量都比较高,推测该转录本与Sb时期菌柄伸长相关.
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