【摘 要】
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从实验室前期茶树冷驯化转录组测序结果中筛选拼接得到1条与其他植物PIN蛋白高度相似的EST序列,采用反转录PCR结合RACE技术从茶树中克隆到生长素外运载体基因PIN3的全长c
【机 构】
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中国农业科学院茶叶研究所/国家茶树改良中心/农业部茶树生物学与资源利用重点实验室,杭州310008
【出 处】
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长三角“物联网与现代农业”研究生学术论坛
论文部分内容阅读
从实验室前期茶树冷驯化转录组测序结果中筛选拼接得到1条与其他植物PIN蛋白高度相似的EST序列,采用反转录PCR结合RACE技术从茶树中克隆到生长素外运载体基因PIN3的全长cDNA序列,命名为CsPIN3(GenBank登陆号为KP896474).生物信息学分析显示,CsPIN3编码的蛋白质分子量为70.15 kD,理论等电点为8.42,是一种非分泌性蛋白；亚细胞定位显示,CsPIN3主要分布于质膜上,在内质网中有少量分布,是典型的膜蛋白；氨基酸序列分析表明CsPIN3编码蛋白由两端的疏水区和中间的亲水区构成.亲水区存在2个可变结构域,还存在着糖基化位点和磷酸化位点；相似性及系统进化分析表明,该基因编码的氨基酸序列具有较高的保守性,与其他植物的PIN序列相似性在80％以上,与茄科植物的亲缘关系最近.组织表达特异性分析表明CsPIN3在茶树根、茎、叶、花中均有表达.实时定量PCR分析显示,CsPIN3在龙井43茶树越冬芽萌发阶段的表达量均高于休眠阶段(休眠初期到膨大期之间)且都在茶芽萌动过程中表达上调的速度明显.推测该基因可能与茶树越冬芽休眠的维持和解除相关.
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