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自脉冲行为是制约光纤激光器功率提高的关键因素之一，可以在激光总输出平均功率不是很高是情况下，引起系统内部光纤和光学器件的损坏.本功文研究了1064 nm波段单频连续高功率全光纤级联放大器中自脉冲现象的产生机理及抑制措施.首先，搭建了一套高功率连续单频全光纤级联放大器，通过实验研究观察到仅在20W量级的方法激光输出功率下就产生了重复频率在3.5 MHz的自脉冲现象.为了抑制自脉冲产生，通过模拟仿真构建了基于速率方程的自脉冲理论模型，分析得到产生MHz量级自脉冲的主要原因是二级隔离器的输出耦合端面端与主放大器的输出端面之间形成腔振荡.通过改进实验系统，破坏两个端面形成腔反馈条件，有效的将自脉冲产生的阈值提高到百瓦量级.