采用PCR-DGGE技术分析瘤胃细菌在不同纤维素富集条件下的多样性

来源 :中国畜牧兽医学会动物微生态学分会第十一次全国学术研讨会暨第五届会员代表大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:RIshan
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  本试验旨在研究不同纤维素富集培养条件下瘤胃细菌的多样性.试验采用CMC、PCS、J和K培养基在37℃和50℃条件下培养瘤胃内容物,使用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术结合DGGE图谱共性及特异性条带的克隆和测序,同时采用聚类分析和主成分分析(PCA)方法分析试验结果.结果表明:37℃条件下不同培养基的DGGE图谱差异较大,J和PCS培养基间的相似性系数为0.77;J和CMC培养基间的相似性系数仅为0.76.50℃条件下不同培养基的DGGE图谱相似性较高,J和PCS培养基间的相似性系数为0.78;而CMC和PCS培养基间的相似性系数高达0.84.DGGE图谱中共性条带序列表明瘤胃优势细菌主要是Streptococcus gallolyticus、Ureibacillus themosphaericus,而特异性条带主要是Lachnospiraceae、Pseudomonas mosselii以及Alcaligenes.不同纤维素富集培养基和温度在一定程度上影响瘤胃细菌的多样性.
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