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目的 表观遗传学研究发现,DNA异常甲基化与恶性肿瘤发生发展的关系密切.本文通过对目前几种常用的DNA甲基化检测方法进行比较,以筛选出方便、快捷、高效的DNA甲基化检测方法.方法 分析BSP(亚硫酸氢钠测序)、COBRA(亚硫酸氢钠处理限制性酶切)、McCOBRA、MSP(甲基化特异性PCR)、限制性PCR、甲基化转移酶、DHPLC(变相高效液相色谱)及Methylight(甲基化程度荧光定量)等DNA甲基化检测方法的准确性、灵敏度、特异性及实用性等,分析各种方法的优缺点.结果 BSP法虽较为繁杂、费用较高,但是目前检测DNA甲基化最直接、最可靠的方法.COBRA法检测甲基化灵敏度高,且可定量检测,在比较完全甲基化和未甲基化时常用,因其使用PCR扩增产物进行酶切,可避免不完全酶切所引起的假阳性,因此,该方法快速、简便,适合大样本量检测；McCOBRA是在COBRA基础上结合溶解曲线分析的方法,能简便、快捷的检测出待测样品中特定CPG位点的DNA甲基化的百分比,较COBRA法更进一步；MSP法是目前应用最广泛的检测CPG岛甲基化的方法,其特异性高,灵敏度高,能够检测出比例为千分之一的甲基化片段.此法操作简便,费用小.合理的引物设计是决定MSP正确与否的关键,要设计多个完全甲基化和非甲基化CPG位点区域,但该区域的CPG岛并不多,故限制了MSP的使用.限制性PCR法,此法相对简单,费用低廉且易于掌握,能通过内切酶的识别位点来反映甲基化的精确定位,但不能反映出整个CPG岛甲基化状态.甲基化转移酶法,用于检测DNA甲基化整体水平的变化,但由甲基化转移酶性质不稳定,导致操作结果的误差较大,故其推广应用受限制.DHPLC法适用组织结构成分混杂,甲基化和非甲基化模板同时存在的组织样品,该法能检测整个扩增区域CPG位点的甲基化,但无法检测待定位点的甲基化.Methylight法是基于实时荧光定量PCR检测技术基础上的DNA甲基化检测方法,可实现高通量、高敏感性和高特异性,但该方法所需的仪器和探针价格昂贵,故限制其推广应用.结论 上述各种方法虽各有其优缺点,但BSP方法及MSP法在检测DNA甲基化方面存在明显优势,上述方法的推广使用对恶性肿瘤的早期筛查和治疗,以及改善患者预后等方面具有重要意义.