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基于经贸权益、提升经济发展层次、扩展与各国经贸咨商管道及提升国际地位等因素之考量，台湾于1990年1月1日以“台、澎、金、马关税领域”名称向“关税暨贸易总协议”(GATT)提出入会申请。1995年“世界贸易组织”(World Trade Organization，WTO)取代GATT，台湾申请入会案更改为加入WTO，至1998年2月台湾与26个会员进行之农业双边咨商已全部完成，并于2002年1月顺利成为“世界贸易组织”的第144个正式会员。台湾在加入世贸组织之后，虽可带来许多总体经贸的效益，但亦须履行人会前咨商时所做之承诺，亦即调降农产品之进口关税，消除进口管制、限制地区进口及削减境内支持水准等保护措施。在贸易自由化之下，短期内势必对台湾农业造成不利之影响，而自由化程度的持续加深，在长期亦将促使台湾农业结构改变。台湾在面对未来市场国际化之挑战，要如何调整农业部门之生产结构以兼顾全民生活与环境生态，进而达成农业永续发展之目标，是当前农业部门所面临之重要课题。