【摘 要】
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本文不仅介绍了分子对接的基本原理、分子对接常用方法和常用软件,还介绍了分子对接在新药研发中的具体应用.指出计算机辅助药物设计是综合数学、物理、化学、计算机、生物学和信息学等多学科互动合作的一门新兴技术,由于其合理、快速和高效的优势,在药物的研发领域得到了广泛应用,同时也取得了巨大进展。但分子对接也存在很多问题,如过于简单的分子模型,受体蛋白质分子柔性参数众多,较大的构象变化在所结合的多分子复合物处
【机 构】
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北京中医药大学中药学院,北京,100102
【出 处】
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中华中医药学会第十一届中药化学年会
论文部分内容阅读
本文不仅介绍了分子对接的基本原理、分子对接常用方法和常用软件,还介绍了分子对接在新药研发中的具体应用.指出计算机辅助药物设计是综合数学、物理、化学、计算机、生物学和信息学等多学科互动合作的一门新兴技术,由于其合理、快速和高效的优势,在药物的研发领域得到了广泛应用,同时也取得了巨大进展。但分子对接也存在很多问题,如过于简单的分子模型,受体蛋白质分子柔性参数众多,较大的构象变化在所结合的多分子复合物处理不是非常理想,所以所得出的对接分子模型仅能作为一定范围的参考。势函数是把一个在多粒子体系中按照一定的量子力学规则上相互作用,以原子对间相互作用的和来表示,这对于生物体系中纷繁复杂的生物化学作用显然是不够的。因此,分子对接作为计算机辅助药物设计的一种重要方法,其搜索算法和打分函数是目前分子对接的难点和热点,随着化学计算理论和方法的不断发展,有望利用分子对接方法设计并优化更多的药物先导物。
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