基于单粒观察值的胚乳性状QTL定位的极大似然方法

来源 :第三届全国动植物数量遗传学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mengjie86
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
谷类作物品质性状的遗传改良已成为国际性的一大育种目标.品质性状的遗传研究是其改良的基础.而谷物胚乳性状是决定谷物品质一类重要性状.由于胚乳是由雌性的两个极核和雄性的一个精核受精发育而成的三倍体组织,其具有比通常二倍体农艺性状更为复杂的遗传基础.尽管胚乳性状数量遗传模型的建立和应用极大地促进了谷物品质性状遗传研究的深化,然而对于控制复杂胚乳性状的基因进行定位直到近年才日益受到重视.近几年来,已发展了一些专用于胚乳性状数量基因座(QTL)区间作图的统计方法.徐辰武等首次报道的利用分子标记对胚乳性状进行QTL图谱构建的双侧标记基因型均值回归方法.该方法的优点是计算速度快,其不足在于未能考虑标记基因型内QTL方差的异质性和QTL基因型的混合分布特性,以及无法分开估计胚乳性状的两种显性效应,只能将其合并估计.Xu等进一步根据标记基因型内QTL方差的异质性,提出专用于方差异质的胚乳性状QTL迭代重新加权最小平方法,但其仍无法区分两种显性效应,而且也忽略了标记基因型内QTL基因型的混合分布特性.Wu等提出了基于F3单粒种子观察值的胚乳QTL定位模型,但其模型仅针对每个F2植株上只观测一粒F3种子的情形.继而Wu等进一步提出可以利用分离群体的植株和该植株上自交种子的胚的分子标记基因型联合推断胚乳QTL基因型的胚乳性状QTL作图方法.此方法由于利用了两个世代DNA的信息,故可以提高QTL的作图精度.但它试验成本显著增加,而带来的精度提高并不明显.本文是根据三倍体胚乳性状的数量遗传模型,利用分布于染色体上的多个分子标记信息,以分离群体中各植株的分子标记基因型以及植株上若干粒种子胚乳性状的单粒观察值为数据模式,通过EM算法实现的极大似然方法对胚乳性状数量基因进行区间作图.由于该方法充分利用了QTL基因型的混合分布特性,故有助于增加QTL定位的效率和精度.此方法的可行性和有效性已通过计算机模拟数据分析得到了进一步验证.模拟研究结果表明:随着样本容量和遗传力的提高,统计功效逐步增强,QTL位置和效应估计的准确度和精确度亦随之提高.而且此方法可以分开估计胚乳性状的第一和第二显性效应.只是在样本容量较小、遗传力较低时,估计有偏,随着样本容量和遗传力的提高,估计值愈接近于真值.然而,需要注意的是,许多胚乳性状在现有研究水平和实验条件下,单粒测定具有较大误差或根本无法进行单粒定量,而仅可以若干粒胚乳样品进行混合测定,这种情形成为限制此方法应用的客观条件.针对于可以进行单粒定量测定的胚乳性状,此方法的优势在于单粒定量分析的成本增加有限.另外,本文QTL定位模型仅包括胚乳核基因效应,当胚乳性状存在母体效应时,可能造成模型有偏,这也是此方法在应用中需注意的问题.
其他文献
转基因技术是类风湿关节炎研究的一个新型的强有力的工具,已经被成功运用到小鼠类风湿关节炎动物模型中。本文概述了目前转基因技术在类风湿关节炎动物模型研究中的应用状况
目的:研究环磷酰胺(CTX)对BALB/c小鼠肝组织的病理作用。方法:BALB/c小鼠腹腔注射CTX15mg·kg·d连续8d,停药8d后取肝组织,HE染色镜检,观察病理学改变。结果:CTX致肝组织广泛性
将类风湿关节炎的组织移植到重度联合免疫缺陷(SCID)小鼠体内,建成RA-SCID人鼠嵌合体模型.通过模型的研究应用,为类风湿关节炎的诊断和治疗提供了新的手段.本文概述了目前RA-
本文从实验动物环境因素基本要素出发,将其划分为6个子系统,即物理环境子系统(PES)、化学环境子系统(CES)、生物环境子系统(OES)、设施环境子系统(FES)、管理环境子系统(MEFS
目的:观察SPF级18月龄SD大鼠脏器重量、脏器系数的生物学特性指标。方法:选用SPF级18月龄SD大鼠42只,雌雄各半,分别测定体重和14个脏器重量,计算脏器系数。结果: SD大鼠雌雄禁食
通过对山东省不同地区不同植被下土壤样品中木霉量测定分析表明,木霉在不同生态类型土壤中均有分布,木霉分布量的不同通过聚类分析在阀值T=2.114时,生态区分成5类:一般农作物
研究了粉红粘帚霉(Gliocladium roseum)菌株SS-1-1,SH-1-1,STG-21-1和HMS-20-3对油菜菌核病菌(Sclerotinia sclerotiorum)以及立枯丝核菌(Rhizoctonia solaniKuhn)的重寄生作
本研究测定了白灵菇的菇蕾期、发育期和成熟期的营养成分、氨基酸、矿质元素、微量元素和重金属的含量,分析了三个发育时期营养成分的变化.测定结果,商品白灵菇(成熟期)的水
忽地笑(Lycorisaurea)为石蒜属(LycorisHerb)植物的代表种,属秋出叶类型.在种质资源采集过程中,我们发现了一种忽地笑突变型,其叶片生长势弱于野生型,尖端卷曲,叶背面有灰白
利用湿地松(Pinuselliottiivar.elliottii)×洪都拉斯加勒比松(P.caribaeavar.hondurensis)杂种1个F1代家系2个群体和1个自交F2代家系1个群体,以微卫星(SSR)标记为主,辅以少