【摘 要】
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为探讨齐口裂腹鱼在温和气单胞菌感染后的免疫应答机制,采用RNA-Seq技术对齐口裂腹鱼感染温和气单胞菌(0 h、24 h和48h)脾脏组织进行转录组测序.将Unigene在NR、GO和KEGG数据库注释,并对不同组差异基因表达进行分析.结果 显示：脾脏Unigene总数为97,581,在Nr数据库中成功注释27,887条,在GO数据库中成功注释25,105条,在KEGG数据库中成功注释11,884
【机 构】
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西南民族大学青藏高原研究院,四川成都610041 西南民族大学生命科学与技术学院,四川成都6100
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为探讨齐口裂腹鱼在温和气单胞菌感染后的免疫应答机制,采用RNA-Seq技术对齐口裂腹鱼感染温和气单胞菌(0 h、24 h和48h)脾脏组织进行转录组测序.将Unigene在NR、GO和KEGG数据库注释,并对不同组差异基因表达进行分析.结果 显示：脾脏Unigene总数为97,581,在Nr数据库中成功注释27,887条,在GO数据库中成功注释25,105条,在KEGG数据库中成功注释11,884条.24 h与0h之间差异基因数为1044个,差异基因富集的122条代谢通路中有7条为显著性富集通路.48 h与0h相比,差异基因数为1024个,差异基因富集的128条代谢通路中有9条为显著性富集通路.48 h和24 h相比,差异基因数目为886个,差异基因富集的104条代谢通路中有4条为显著性富集通路.三个组共有信号通路为NF-κB的信号通路和低氧诱导因子-1信号通路,并从富集通路中获得了大量免疫相关基因.这为了解齐口裂腹鱼抗菌免疫机制提供参考.
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