埃塞俄比亚芥高密度遗传图谱的构建及其重要农艺性状QTL分析

• 作 者: 邹珺[1]胡丹丹[1]罗子良[1]郭少敏[2]魏子立[1]付忠[2]杜德志[2]HarshRaman[3]孟金陵[1]
• 机 构: 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,农业部油菜遗传育种重点实验室,湖北武汉,430070
• 出 处: 中国作物学会油料作物专业委员会第七次会员代表大会暨学术年会
• 发表日期: 2013年期

　　在最近发表的第一张包含212个遗传位点的埃塞俄比亚芥遗传图谱基础上,我们对该埃塞俄比亚芥遗传作图群体进一步进行了基于测序的基因型分析,获得了约5 000个包含有70bp序列信息的多态性DArT标记,并构建了一张包含有1 366个遗传位点、4 032个标记、639个bin,长2 048cM的新图谱.通过遗传图谱上标记所包含的70bp序列信息与拟南芥基因组进行比对,在该遗传图谱上鉴定到了136个芸薹保守区域.通过遗传图谱的比较分析发现,埃塞俄比亚芥(BBCC)中的B/C基因组与芥菜型油菜/黑芥中的B基因组,以及甘蓝型油菜的C基因组分别有约85％和80％的保守性；在不同的B、C亚基因组内,检测到了一些明显的倒位等基因组变异.将该遗传作图群体种植于冬油菜和春油菜环境中考察其重要的农艺性状,在不同环境中共检测到了约50个控制种子产量及产量构成因子的QTL.我们检测到了24个与开花期和蕾期相关的QTL,对这些QTL进行分析并与甘蓝型油菜C基因组上的开花期QTL进行了比较.其中,我们在B4基因组上的J block于春冬生长环境中同时检测到了一个控制开花的主效QTL(qFT.B4-2),该QTL区域与一个蕾期主效QTL重叠.在C6基因组上的E block,于冬油菜环境下检测到了一个开花期主效QTL,该QTL与甘蓝型油菜C6染色体E blcok上控制开花的QTL同源.在这两个主效QTL区间,我们通过与拟南芥比对,也找到了一些开花相关的基因.