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关于烟草赤星病病原物的名称，学术界长期存在着Ａｌｔｅｒｎａｒｉａ ｌｏｎｇｉｐｅｓ与Ａ．ａｌｔｅｒｎａｔａ二名并用的局面而未能统一。作者依二类菌系基因组ＤＮＡ随机扩增多态性（ＲＡＰＤ）研究结果，曾主张采用后一名称。考虑到该病原物以其对烟草具明确的致病性而不同于一般的Ａ．ａｌｔｅｒｎａｔａ菌系，现建议将其定名为链格孢烟草专化型。