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目的 分析环境与临床分离大肠埃希菌中CRISPR位点的分布差异及其与耐药的关系.方法 PCR扩增CRISPR位点和耐药基因后测序,CRISPR Finder软件查找CRISPR位点,CRISPR Target软件分析间隔序列；采用改良K-B纸片法进行药敏试验.结果 临床和环境分离大肠埃希菌中均能检测出三个CRISPR位点,临床分离大肠埃希菌CRISPR3位点检出率高于环境分离大肠埃希菌且差异有统计学意义(x2=21.626,P=0.000)；环境分离大肠埃希菌对多种抗生素敏感,临床分离大肠埃希菌对多种抗生素耐药甚至MDR (multi-drug resistance)；临床分离大肠埃希菌tetA(x2=7.056,P=0.008)和sul2(P=0.001)耐药基因检出率均高于环境分离大肠埃希菌,且差异均有统计学意义；临床分离大肠埃希菌CRISPR1 (x2=5.566,P=0.018)及CRISPR2(P=0.034)位点与复方新诺明的耐药分布差异均有统计学意义,环境分离大肠埃希菌CRISPR1 (P=0.000)、CRISPR2 (P=0.002)、CRISPR3 (P=0.012)位点与阿莫西林棒酸分布差异具有统计学意义.结论 环境与临床分离大肠埃希菌中均能检测出CRISPR1、CRISPR2和CRISPR3位点；环境与临床分离大肠埃希菌的CRJSPR位点与耐药表型和耐药基因分布存在差异；环境分离大肠埃希菌多为敏感菌,临床分离大肠埃希菌多为MDR.