【摘 要】
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转运蛋白是生物体内负责物质输送的蛋白质,对生物体的生长、发育和次生代谢有重要作用。通过对灵芝基因组的搜索和TCDB比对,我们在灵芝基因组内鉴定了 1063个转运蛋白,分属134个家族。其中PILS转运蛋白家族是拟南芥中新近鉴定的一类与生长素转运相关的膜蛋白家族,参与拟南芥中生长素极性的调节。不同于经典PIN家族转运蛋白,PILS不仅存在于植物中,而且在真核生物中广泛存在。我们通过结构域搜索和同源比
【机 构】
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中国医学科学院,北京协和医学院药用植物研究所,北京 100193 北京大学,生命科学学院,北京 1
【出 处】
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中药与天然药高峰论坛暨第十二届全国中药和天然药物学术研讨会
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转运蛋白是生物体内负责物质输送的蛋白质,对生物体的生长、发育和次生代谢有重要作用。通过对灵芝基因组的搜索和TCDB比对,我们在灵芝基因组内鉴定了 1063个转运蛋白,分属134个家族。其中PILS转运蛋白家族是拟南芥中新近鉴定的一类与生长素转运相关的膜蛋白家族,参与拟南芥中生长素极性的调节。不同于经典PIN家族转运蛋白,PILS不仅存在于植物中,而且在真核生物中广泛存在。我们通过结构域搜索和同源比对鉴定出灵芝PILS蛋白家族包括5个成员,通过RNA-seq数据发现不同蛋白在灵芝不同发育阶段有不同的表达,暗示这5个PILS蛋白功能可能存在差异。进一步,我们通过生长素诱导实验验证灵芝在不同生长素浓度处理下具有不同的表型。目前,我们已经从灵芝cDNA文库中成功克隆了这5个蛋白中的3个,我们也成功建立了基于绿色荧光蛋白为报告系统的灵芝转化系统,下一步实验中,我们将观察了PILS家族在不同浓度IAA处理下表达和分布的变化,并希望研究灵芝中激素和次生代谢产物的关系。
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