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病毒性疾病属于中医学“瘟疫”的范畴，历代医家在运用中医药防治瘟疫的过程中形成了独特且较为完整的理论与临床诊疗体系。通过对中药与西药治疗病毒性疾病的对比分析得出中医药治疗本病的主要优势：重视整体观念可有效减少病毒危害、重视辨证论治可有效避免耐药性产生，且中药安全性高、价格低廉。然而，中医药治疗本病尚存在着“古方今病不相宜”的困难，本文对迎接挑战、解决困难作出论述，以明确中医药治疗病毒性疾病应当前进的方向和目标。