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本研究从Genbank上的26对毛蚶微卫星引物序列中筛选出8对扩增和分型效果较好的微卫星引物，用这8对微卫星引物对3个毛蚶群体的基因组DNA进行PCR检测并对8个微卫星标记基因型与毛蚶数量性状的相关性进行了分析。结果表明：烟台群体中，位点FJ188702与鲜重显著相关，位点FJ188712与壳高和壳宽显著相关；秦皇岛群体中，位点FJ188702与壳宽显著相关，位点FJ188712与壳长显著相关，位点EU483144与壳长、壳高、鲜重和软体重均显著相关，位点EU483147与壳宽显著相关；温州群体中，位点EU483145与软体重显著相关，其它位点与各数量性状均无显著相关性。