广西来宾市五里塘普通野生稻(oryza rufipogon griff.)居群遗传多样性与核心种质研究.pdf

收藏

编号:20181111065505917353    类型:共享资源    大小:344.90KB    格式:PDF    上传时间:2019-02-16
  
3
金币
关 键 词:
广西来宾市五里塘普通野生稻(oryzarufipogongriff.)居群遗传多样性与核心种质研究
资源描述:
2008年21卷2期 番南农卫夸报 VoL 21 No.2 Southwest China Journal of Agricultural Sciences 245 文章编号:1001—4829(2008)02—0245—05 广西来宾市五里塘普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.) 居群遗传多样性与核心种质研究 黄金艳”,陈 淼“”,梁燕理∽,一,刘 驰4,陈英之∽…,马增凤1…, 黄大辉4,杨新庆4,李丹婷4,莫良玉2”,李容柏1’2’3’4。 (1.广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,广西南宁530007;2.广西大学农学院,广西南宁530005;3.广西亚热带生物 资源保护利用重点实验室,广西南宁530005;4.广西农业科学院水稻研究所,广西南宁530007;5.广西农业科学院园艺研究 所。广西南宁530007) 摘要:以位于北回归线穿越昀广西中部西江流域的来宾市五里塘285份普通野生稻样本为材料,利用平均分布予水稻12条染色 体上的24个微卫星标记进行遗传多样性分析。结果显示:24对微卫星标记引物共检测到73个等位基因,平均每对引物得到3 个,平均多态信忠含量(只rc)为0.4177,平均遗传杂合度(目)为0.4245,说明这些瞢通野生稻材料中有丰富的遗传多样性。通过 逐步聚类分析,从285份材料中选出30份作为核心种质,该核心种质包含了24个微卫星标记能够检测到的所有基因突变位点,基 本上可以代表该居群的遗传多样性。研究结果对居群的种质评估、遗传多样性保护和资源利用提供了参考依据。鉴于广西来宾 市五里塘普通野生稻遗传多样性较丰富,建议对该原生地的现有居群进行重点保护和利用。 关键词:普通野生稻;核心种质;微卫里标记;遗传多样性 中图分类号:S511.9 文献标识码:A Study on genetic diversity and nucleus germplasm of Wulitang population of common wild rice(Oryza rufipogon Griff.)in Laibin city of Guangxi HUANG Jin-yaalj,CHEN Misal-2一,LIANG Yan-lil,2.一。LIU Chi‘。CHEN Ying-小i1·2.-。 MA Zeug-fen91.-,HUANG Da-hui4,YANG Xin-qings,LI Dan一6n94,MO Lisag-yu2一,u Rong-bai‘·2·3·4’ 0.5时,该位点为 高度多态位点;当0.25PIC0.5时,该位点为中 度多态位点;当PIC0.25时,该位点为低度多态位 点。在本研究选用的24个微卫星标记中,多态信息 含量在0.0317—0.7638之问,平均为0.4177,其中 有12个位点属于高度多态位点,4个位点属于中度 多态位点,其余为低度多态位点。表明广西五里塘 普通野生稻居群PIC整体水平中等,遗传多样性较 丰富。遗传杂合度(日)能够反映群体在各位点的遗 传变异,是度量群体遗传变异的理想参数。李小湘 等【l引对湖南江永普通野生稻原位保存居群进行遗 传多样性分析,结果显示居群平均杂合度为0.304; 余萍等¨刚对广西普通野生稻异位保护部分材料的 研究表明,其平均杂合度也只是0.320;杨庆文 等口2瑚1分别对广东高州普通野生稻3个群体和海 拔最高的云南元江普通野生稻天然居群进行遗传多 样性分析,结果显示平均杂合度分别为0.4292和 0.50。广西来宾市五里塘普通野生稻天然居群的平 均杂合度为0.4177,高于湖南江永普通野生稻原位 保存居群和广西普通野生稻异位保护群体,而低于 广东高州普通野生稻和云南元江普通野生稻天然居 群,遗传多样性较丰富,具有很高的保护和利用价 值。研究结果再次印证了分布于北回归线的普通野 生稻群体具有丰富的遗传多样性p一引。 核心种质(Core collection)概念由Frankel和 Brown㈨于1984年提出,BIUwn[圳将其进一步完 善,即从整个种质资源中选择一部分样本,以最少的 万方数据 膏南袁量牵奴 2l卷 遗传资源份数最大限度地代表该物种的遗传多样 性。取样方法是核心种质构建的核心问题。Diwan 等∞1对11种取样方法进行比较分析后,认为聚类 分组法构建的核心种质比大随机方法更能代表该物 种的遗传多样性。孙传清等Ⅲ1的研究也表明聚类 法构建的核心样本比随机法更能保持物种的遗传多 样性。另外。代表性是核心种质的重要特征。 Frankel和Brown【2l】提出以最小的样本代表70% 遗传多样性的核心种质评价标准,即要求核心种质 对整个遗传资源等位基因的代表性达到70%以 上Ⅲ】。本研究在DNA水平上,通过逐步聚类分析, 从原始样本中筛选出lO%的样本作为核心样本。 该核心样本包含整个资源100%的遗传变异,超过 了Frankel和Brownl2”提出的70%评价标准。表明 该核心样本含有丰富的遗传多样性。 利用SSR.PCR技术可以产生大量的多态DNA 标记,这些标记已经广泛应用于野生资源研究,在普 通野生稻的研究中也很常见。有研究表明,在野生 稻研究中所用的SSR标记均有很大不同汹瑚】。本 研究中,24对SSR引物共检测到73个等位基因,平 均每对引物得到3.0833个,略低于其他研究结 果m瑚啪】。不同研究中SSR标记所产生的多态性 差异,可能是所用引物不同引起,因此,实践中需使 用更多的引物以更精确地评价群体的遗传变异程 度。 近年来随着经济的快速发展和对资源的过度开 发利用,普通野生稻资源遭到严重破坏,因此,开展 普通野生稻资源保护研究很有必要。针对广西来宾 市五里塘普通野生稻居群的遗传多样性研究只是我 们开展野生稻保护研究的一个例子,其对于研究其 他居群的遗传多样性保护具有较大的参考价值,今 后将在此基础上构建野生稻种群的核心种质,最大 限度地保护野生稻的多样性,使野生稻这一重要的 作物资源持续地为国家经济建设和社会发展服务。 参考文献: [1]孙传清,王象坤,吉村醇,等.普通野生稻和亚洲栽培稻核基因组 的遗传分化[J].中国农业大学学报,1997,2(5):65-71. [2]孙传清,王象坤,吉村醇,等.普通野生稻和亚洲栽培稻线粒体 DNA的RFLP分析[J].遗传学报,1998,25(1):40—45. r3]cha.gTT.TheoriO.,ovolution,cultivation。dissemination and differ- entiation ofAsian and African risc8[J].Euphytiea,1976(25).435— 441. f4]0h tt I.Ori#n lffcultivated rice[M】.Tokyo:Japan Seielitffie Soeie- 矗∞Press.1988. [5]秦学毅,李容柏,韦素美,等.普通野生稻抗褐稻虱基因导人栽培 稻研究[J].广西农业科学。20m(2):57—59. [6]朱作峰,孙传清,付永彩,等.用SSR标记比较亚洲栽培稻与普通 野生稻的遗传多样性[J】.中国农业科学,2002,35(12):1437— 1441. [7]李容柏,陆岗,粱耀懋,等.几个野稻抗源对自叶枯病抗性的遗 传[J】.广西农业科学。1995(1):33—36. [8]Sun cQ,WangXK,Lizc,et.a1..Comparison ofthe genetie diver- sity of commoll wild rice(D归t斫pogon(;rift.)and cultivated flee (0归Jat/mL)u8illgRFLPmarl,哪[J].11l哪^ppl C.e13el,2001, 102:157—162. [9]李亚非,陈成斌,张万霞,等.我国北回归线区域普通野生稻遗传 多样性和遗传结构研究[J].植物遗传资源学报,2007。8(3).280 —284. 【lO]陈成斌.广西北回归线上野生稻遗传多样性探讨[J】.亚热带植 物科学,2001,30(4):5-9. [11]广西野生稻普查考察协作组.广西野生稻的地理分布及其特征 特性[J】.作物品种资源,1983(1).12—17. [12】杨庆文,张万霞,时津霞,等.广东高州普通野生稻(D归ruff- pogon C.riff.)的遗传多样性和居群遗传分化研究[J].植物遗传 资源学报,2004,5(4).315-319. [13]Dellapo血sL,Wood J,ttieks JB,et丑1.A Plant DI、IA lVliniprt.para- lion·Version n[J].Plant 1~!ol llio Rep,1983,1(4):19-21. [14]刘志鹏,杨青川,呼天明,等.用SSR标记研究不同耐盐特性四 倍体紫花苜蓿的遗传多样性[J].2006,32(4):630—632. [15]Shahi BB,l-Iorishima tt,oka tt I.A survey of variations in peroxi— dase锄d phosphatase and eultiv,,t日l i 80巧|mes《wild and cultivated 蛳即∞i∞[J].Japan J C,enet。1967,44:303-319。 [16]高立志,张寿洲,周毅。等.中国野生稻的濒危现状调查[J]. 生物多样性,1996,4(3):160—166. 【17]Botstei N D,White R L,skoln lc K M,et.a1.Comtrueti蛳of a ge- netie linkage map in m“using restriction fi'agrnent length叫ymor- phims[J].AIn J Hun ce嗡,1980,32:314-331. [18]李小湘,詹庆才,魏兴华。等.湖南江永普通野生稻原位和异位 保存种质的SSR多样性差异[J].中国水稻科学。2006.20(4): 361—366. 【19]余萍,李白超,张洪亮,等.广西普通野生稻(D啊ruffed,on (;rift)表型性状和SSR多样性研究[J].遗传学报,2004,31(9): 934—940. [20]扬庆文,戴陆园,时津霞,等.云南元江普通野生稻(D归九乒 pogon)遗传多样性分析及保护策略研究[J].植物遗传资源学 报,2004,5(1):1—5. [21]Frankel 0 H,Brown A tt D.Current plant genetic IrCSOtlI“C∞a eriti- eal appraisal[1Vl】.Genetics.New FrontiersⅧ.Ⅳ.Oxford and IBH Publishing,1984. [22]Brown A H D.11砖c雠foreoi,ecollections.In:Brown A H D。ccll (eds.),Thell9e qffplant genetic他鲫JI嘲[M].England·Cambridge Univ Press.1989.136—156. [23]DiwanN,l~leInt06hM s,BauehanCR.Methods aI“developinga C,Ol'e collection of annual raedieago st∞eies[J].Theor Appl C,enet,1995, 90:755—761. [24]孙传清,李白超,王象坤.普通野生稻和亚溯栽培稻核心种质遗 传多样性的检测研究[J】.作物学报。2001,27(3):313—318. [25】崔艳华,邱丽娟,常汝镇,等.利用SSR分子标记检测黄淮夏大 万方数据 2期 黄金艳等:广西来宾市五里塘普通野生稻(铆∞删铷鲫Griff.)居群遗传多样性与核心种质研究 249 豆(Gl狮ne m一)初选核心样本的代表性[J].植物遗传资源学 报,2003.4(1):9—15. [26】谢建坤,陈大洲,肖叶青,等.应用微卫星标记分析东乡野生稻 遗传多样性初探[刀.中国农业科学,2003,36(8):873—878. [27]郑景生,陈良兵,符文英.野生稻不同基因组的SSR多样性分析 [J].分子植物育种,2004,2(1):25-33. [28]任民,陈成斌,荣廷昭,等,桂东南地区普通野生稻遗传多样 性研究[J].植物遗传资源学报,2005,6(1):31—36. [29]王效宁,韩东飞,云勇,等.利用SSR标记分析海南普通野生稻 的遗传多样性[J】.植物遗传资源学报,2007。8(2):184.一188. (责任编辑林涛) 万方数据
展开阅读全文
  皮皮文库所有资源均是用户自行上传分享,仅供网友学习交流,未经上传用户书面授权,请勿作他用。
0条评论

还可以输入200字符

暂无评论,赶快抢占沙发吧。

关于本文
本文标题:广西来宾市五里塘普通野生稻(oryza rufipogon griff.)居群遗传多样性与核心种质研究.pdf
链接地址:http://www.ppdoc.com/p-10930977.html
关于我们 - 网站声明 - 网站地图 - 资源地图 - 友情链接 - 网站客服客服 - 联系我们

copyright@ 2008-2018 皮皮文库网站版权所有
经营许可证编号:京ICP备12026657号-3 

收起
展开